Die Hauptversammlung ist die Versammlung der Mitglieder des Börsenvereins. Sie findet einmal jährlich statt und wird vom Vorstand einberufen. Die Hauptversammlung wählt die Mitglieder des Vorstands, des Haushalts-Ausschusses und die Rechnungsprüfer. Sie fasst Beschlüsse über Satzungsänderungen, nimmt den Tätigkeitsbericht der Fachausschüsse entgegen und den Jahresbericht des Schatzmeisters, den Jahresabschluss des vergangenen Geschäftsjahres und den Voranschlage des nächsten Geschäftsjahres. In der Hauptversammlung können alle Mitglieder Anträge stellen. Sie trifft ihre Beschlüsse mit einfacher Mehrheit der anwesenden und vertretenen Abstimmungsberechtigten. Anträge auf Änderungen der Satzung müssen der Satzungs- und Schiedskommission vor Behandlung auf der Hauptversammlung vorgelegt werden. Die letzte außerordentliche Hauptversammlung fand am 13. Oktober 2011 während der Frankfurter Buchmesse statt.
Die 198. Hauptversammlung inklusive turnusgemäßer Vorstandswahlen wird im Rahmen der Buchtage Special Edition 2022 (20. und 21. Juni in Frankfurt) stattfinden.